熱水循環(huán)式殺菌：殺菌時鍋內食品全部被熱水浸泡，這種方式熱分布比較均勻。蒸汽式殺菌：食品裝到鍋里后不是先加水，而是直接進蒸汽升溫，由于在殺菌過程中鍋內存在空氣會出現冷點，所以這種方式熱分布不是均勻。

雙層水浴式高溫殺菌鍋分手動型、半自動型及全自動型三種控制方式，采用熱水循環(huán)殺菌方式，有循環(huán)泵和交換閥來改變液體的流動，均等的加熱食品。

電汽兩用殺菌鍋汽源可由電或蒸汽來供給，殺菌前可預先設定到所需要溫度和壓力，通過電接點壓力表進行自動控壓，通過溫控儀控制殺菌溫度，低于一定溫度時可自動加溫，從而確保了在殺菌時溫度的準確性。用蒸汽時可通過鍋爐蒸汽直接進行升溫殺菌。